مطالعه qsar بازدارنده های ضد باکتریایی تیمیدیلات کیناز با استفاده از توصیف کننده های داکینگ مولکولی

پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم پایه دامغان - دانشکده شیمی
نویسنده محمد اکبری مجدآبادی
استاد راهنما مرتضی عتباتی
سال انتشار 1394

چکیده

توسعه و ایجاد یک مدل پیشگویانه برپایه ساختار با استفاده از روش رگرسیون خطی چندگانه براساس اجماع چندین روش داکینگ متفاوت (autodock vina, gold, flexx, surflex and glide) و توصیف کننده های حاصل از نتایج آن ها مورد مطالعه قرار گرفت. رابطه کمی ساختار-فعالیت میان فعالیت بازدارندگی 26 بازدارنده tmk استافیلوکوکوس اورئوس با توصیف کننده های داکینگ ایجاد گشت. برای اطمینان از توانایی پیشگویی مدل، مدل qsar به صورت درونی با استفاده از روش ارزیابی متقاطع loocv مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج مدل (r2 = 0.84, r2cv = 0.79,,re = 4.76%, mse = 0.179) با مدل های qsar حاصل از توصیف کننده های ساختاری قابل مقایسه بودند.

منابع مشابه

مروری بر توصیف کننده های مولکولی مواد پرانرژی در مدل های ارائه شده برمبنای qsar/qspr

چکیده: آگاهی از ساختار مولکولی کلید فهم عملکرد مولکولهاست و این به دلیل ارتباطی است که بین ساختار و ویژگی های یک ترکیب وجود دارد و خواص ماکروسکوپی و میکروسکوپی آن را به هم مرتبط می کند. انجام بسیاری از کارهای آزمایشگاهی نیازمند صرف وقت و هزینه ی بسیار می باشد. qspr روشی است که امکان دستیابی به داده ها و اطلاعات مورد نظر را با صرف حداقل وقت و هزینه فراهم می آورد. از آنجا که تحقیقات آزمایشگاهی بر...

متن کامل

مطالعات داکینگ و QSAR بر روی گروهی از مشتقات تری‌آزول به‌منظور دست‌یابی به عوامل ضد قارچ قوی‌تر و مؤثرتر

اهداف: در این مطالعه، بر روی یک دسته از مشتقات تری‌آزول با اثر مهارکنندگی آنزیم CYP51 مطالعات داکینگ و به دنبال آن آنالیز رابطه فعالیت و ساختار کمی (QSAR) انجام گرفت. روش‌ها: با استفاده از برنامه‌ی Hyperchem ساختار مولکولی آزول‌های طراحی‌شده ساخته شد. برای انجام مطالعات داکینگ از برنامه AutoDock استفاده شد. در مطالعات QSAR، توصیف‌گرهای مختلفی محاسبه گردیدند. یافته‌ها: بر اساس نتایج به‌دست‌آمده ...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی برخی از پایه های پاکوتاه کننده سیب با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

در این تحقیق تنوع ژنتیکی 19 پایه اصلاح شده سیب در انگلستان و روسیه که از مناطق مختلف ایران جمع آوری شده همراه با 12 ژنوتیپ و پنج نمونه حاصل از کشت بافت به کمک نشانگرDNA (RAPD) مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 100 آغازگر تصادفی در انجام واکنش PCR روی نمونه ها ارزیابی شد که 10 آغازگر تکثیر DNA الگو را به خوبی انجام داده و بین نمونه ها چند شکلی قابل ملاحظه ای نشان دادند. این 10 آغاز گر در مجموع 160 بان...

متن کامل

جداسازی و شناسایی مولکولی باسیلوس تولید کننده لانتی بیوتیک از خاک و بررسی اثرات ضد باکتریایی آن

سابقه و هدف: لانتی بیوتیک ها آنتی بیوتیک های پپتیدی کوچکی هستند که بسیاری از باکتری های گرم مثبت علیه دیگر باکتری ها تولید می نمایند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باسیلوس های تولید کننده لانتی بیوتیک از خاک و همچنین ارزیابی شرایط بهینه تولید و فعالیت ضد باکتریایی لانتی بیوتیک تولیدی انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه بنیادی نمونه ها از خاک مزارع لوبیا سبز در استان فارس جمع آ...

متن کامل

جداسازی و شناسایی مولکولی باسیلوس تولید کننده لانتی بیوتیک از خاک و بررسی اثرات ضد باکتریایی آن

متن کامل

اثرات ضدبیوفیلمی و ضد باکتریایی سویه های تولید کننده باکتریوسین اشریشیا کلی و باسیلوس سوبتلیس

سابقه و هدف: شیوع عفونت، به‌ همراه گسترش باکتری‌ها‌ی مقاوم به آنتی‌بیوتیک‌، سبب شده است که ترکیبات پپتیدی تولید شده توسط باکتری‌ها (باکتریوسین‌ها) مورد توجه قرار گیرند. این مطالعه با هدف مقایسه اثر ضد میکروبی در باکتری‌های دارای توانایی تولید باکتریوسین انجام شد. مواد و روش ‌ها: فعالیت بازدارندگی باکتری‌های جدا شده از خاک نواحی مختلف سم...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}

نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم پایه دامغان - دانشکده شیمی

کلمات کلیدی

رابطه کمی ساختار فعالیت تیمیدیلات کیناز داکینگ

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com